AAV1~AAV10のpI計算
以下の文献には，表面構成タンパク質について個別にpIを算出されていますが，ウイルス粒子を構成する天然の状態でのpIは，表面に出ているアミノ酸の分布割合に依存します。そのため、正確なpIが算出されているとは考えにくと考えられます．やはり，実際にAEXなどのクロマト法などで検定されている結果の方が信頼できると思われます．
しかし，組換えAAVでは，以下の「AAV8, AAV9のpI」で示したようにEmpty/Fullの違いでpIが異なることが知られています．すなわち，GOIの配列によってもpIは異なると考えられます．単純計算ではいかないようですね．
Calculated pI values for AAV1 to AAV12.
https://www.researchgate.net/figure/Calculated-pI-values-for-AAV1-to-AAV12-The-histogram-of-the-pI-values-for-the-AAV_fig1_235682725
AAV8, AAV9のpI
AAV8とAAV9のpIを分析カラムメーカーSCIEX社が報告しています．
- AAV8 : 約pI9
- AAV9 : pI7.1~7.6
Determination of Full, Partial and Empty Capsid Ratios
for Adeno-Associated Virus (AAV) Analysis
Tingting Li, Tie Gao, Hongxu Chen, Zuzana Demianova, Fang Wang, Mukesh Malik, Jane Luo,
Handy Yowanto, Sahana Mollah
SCIEX, Brea, CA
https://sciex.com/Documents/tech%20notes/2019/AAV-Full-Partial-Empty.pdf
AAV tree
参考まで，AAV系統樹について示しておきます．pIの関連があるかも知れません．今後調査するかもです．
Expanded Repertoire of AAV Vector Serotypes Mediate Unique Patterns of Transduction in Mouse Brain
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1525001616320755
編集履歴
2020/11/04 S2IND 2021/02/08 文言整備 2021/02/23 追記 (「はじめに」を追加し、工業化の課題について言及)